Soutenance de thèse de Roch Sobczyk

Titre

Mise au point de dispositifs micro-fluidiques pour détecter les bactéries / SEPSIS par nanoluminescence

Résumé

L'antibiorésistance bactérienne est un phénomène qui conduit les bactéries à résister à l'action d'antibiotiques. Celui ci constitue un problème de santé mondiale au point que l'OMS soit en alerte sur ce sujet depuis plusieurs années. Afin de limiter l'accentuation de ce problème, diverses mesures sont prises afin de réduire l'utilisation d'antibiotiques dans l'agriculture et l'élevage. De plus, plusieurs solutions existent, telles que le développement de nouveaux antibiotiques, ou l'utilisation combinées de plusieurs d'entre eux. Cependant, bien que ces mesures soient nécessaires, il est également vital d'être en mesure de détecter précocement les bactéries, et de vérifier leur capacité à résister ou non aux traitements. De nombreux moyens de détection existent d'ores et déjà, mais les plus couramment utilisés présentent des inconvénients tels qu'une détection lente, pas toujours sélective, ou demandent de grandes quantités de réactifs coûteux, ce qui les rend onéreuses. Les travaux menés durant cette thèse ont visé à la conception et au développement d'un multidétecteur devant permettre un suivi de l'activité microbienne par le suivi du pH, car celle-ci s'accompagne souvent d'une variation de l'acidité du milieu, ainsi que la détection sélective de la présence de bactéries. Celui-ci est donc composé d'un cœur sous forme de QD de CdSe auquel est lié une cyanine pH sensible, et un BODIPY servant de sonde sélective à bactéries Gram+. Dans un premier temps, la synthèse de la cyanine a été réalisée et optimisée, puis ses propriétés spectroscopiques et biologiques ont été étudiées. La toxicité observée a ensuite mené au développement d'optodes à pH utilisant une matrice d'HydroMed-D4. Dans un second temps, les QD ont été synthétisés, et leurs propriétés spectroscopiques étudiées. Puis des essais concluants d'échange de ligands ont été menés. Cependant, leur dégradation en milieu aqueux salin n'a pas été résolue, malgré l'exploration de plusieurs pistes, ce qui les rends non exploitables en milieu biologique. Enfin, la synthèse du BODIPY a été initiée, mais n'a pas pu être finalisée faute de temps. Des perspectives quant à l'amélioration du travail réalisé dans cette thèse ont été proposées, ainsi que des perspectives concernant le développement à plus long terme du projet initial de la thèse.

Direction de thèse

• Directrice : Rachel Méallet, Professeur, ISMO, Université Paris-Saclay
• Co-directrice : Isabelle Leray, Directrice de Recherche, PPSM, CNRS - ENS Paris-Saclay

Composition du jury

• Thanh Ha-Duong, Maitresse de conférences, ITODYS, Université Paris-Cité, Rapportrice

• Thibault Gallavardin, Chargé de Recherche, CARMeN, Université de Rouen Normandie, Rapporteur

• Hafsa Korri-Youssoufi, Directrice de Recherche, ICMMO, Université Paris-Saclay, Examinatrice

• Christophe Coudret, Directeur de Recherches, Softmat, Université de Toulouse, Examinateur

• Michel Sliwa, Directeur de Recherches, LASIRE, Université de Lille, Examinateur